新疆科发环境工程有限公司是:新疆碧水源环境资源股份有限公司旗下的子公司，都在总公司办公。
新疆碧水源环境资源股份有限公司（以下简称碧水源公司）,成立于2011年，主要从事市政生活给水、市政生活污水和工业废水的资源化处理等项目投资、建设及运营。2012年5月，公司为了更好地在新疆区域内开展污水资源化业务，引入战略合作伙伴——北京碧水源科技股份有限公司，并引进其核心工艺MBR膜，在新疆建设膜及膜组器等碧水源专有技术和产品的科研生产基地，并在新疆及周边地区全面推广膜生物污水处理技术，在污水处理领域取得辉煌成绩,解决了新疆水脏、水少的问题,新疆碧水源拥有14家水处理子公司、4家环保科技子公司、1家生物科技公司、1家水务公司、1家环境工程子公司。并且拥有经自治区经信委、兵团发改委、自治区财政厅、自治区国税局、自治区地税局、乌鲁木齐海关联合审批认定的自治区级企业技术中心；拥有发明专利4项，实用新型专利10项；是乌鲁木齐市创新型企业；通过了质量管理体系、环境管理体系和职业健康安全管理体系认证；是自治区生态环境厅确定的新疆城市污水处理行业唯一的“环境污染第三方治理试点企业”。
2011年5月，新疆碧水源环境资源股份有限公司成立。
2012年5月，引入北京碧水源科技股份有限公司作为战略投资人。同年11月，签订米东区再生水厂工程BOT项目。
2013年07月， 签约乌鲁木齐市米东区化工工业园污水处理厂工程BOT项目。
2014年10月 ，签约沙湾县第二污水厂工程BOT项目。
2015年7月，签约奇台县城污水处理厂委托运营协议并开始商业运营。
2016年4月，签约奇台县污水处理厂提标改造工程BOT项目；9月，签订和硕县污水处理厂改扩建及配套管网工程PPP项目。
2017年，签约阜康、木垒、尉犁、伊宁、和静五个地区的6个PPP项目。
2018年4月，中标赛里木湖景点给排水工程；8月，签约米东区污水处理厂PPP项目；10月，且末污水处理升级改造工程建成投入运营。
2019年4月，巴州且末县2个项目投入运行；6月接受政府委托运营奇台及沙湾项目并中标和硕一体化供水工程。
